Команда исследователей из Дюссельдорфского университета имени Генриха Гейне реконструировала старейшую метаболическую сеть, общую для всех живых организмов. Они обнаружили, что ключевые ферменты бактерий и архей развивались отдельно. Это указывает на то, что переход к свободноживущим клеткам произошел как минимум дважды.
Как проводилось исследование
Методология работы основана на сравнении генов, кодирующих метаболические ферменты у современных бактерий и архей. Ученые определили общий набор реакций, унаследованных от LUCA, но также обнаружили, что обе группы разработали уникальные белковые катализаторы для проведения одних и тех же химических реакций. Это, по мнению авторов, указывает на то, что реакция старше белков: сначала катализаторами служили металлы и неорганические соединения, а позднее эволюция привела к появлению специализированных белков, взявших на себя эти функции.
Особое внимание авторы уделили реакции фосфита с органическими молекулами, которая в присутствии палладия позволила накопить энергию в виде АДФ – предшественника универсальной энергетической «батарейки» АТФ. Именно этот шаг, по их мнению, стал поворотным: он связал геохимические процессы с биохимическими и объяснил, почему фосфор занял центральное место в клеточном метаболизме. Постепенно металлические катализаторы были заменены более специализированными и эффективными ферментами – но в каждой из двух эволюционных линий эта замена протекала независимо, по-разному.
Насколько убедительны выводы?
Это приводит к фундаментальному выводу: переход от химически активной, но еще не живой системы к полноценным свободноживущим клеткам произошел как минимум дважды. Бактерии и археи не являются потомками одной и той же первой клетки; они представляют собой две параллельные ветви, каждая из которых независимо «изобрела» клеточную мембрану, механизмы деления и энергообеспечения, хотя опирались на единую метаболическую основу, унаследованную от LUCA.
Не все исследователи согласны с выводами авторов работы. Кристаллограф Хуан Фонтесилья-Кампс из Института структурной биологии (Франция) считает, что LUCA могла иметь примитивную мембрану, состоящую из смеси липидов, характерных как для бактерий, так и для архей, что предполагает однократный переход к клеточной жизни. Его поддерживает микробиолог Донато Джованнелли (Университет Неаполя), который называет работу «убедительной, но спекулятивной» — по его мнению, мы никогда не сможем точно реконструировать события, произошедшие три миллиарда лет назад.